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自己尝试后，发现以下方式是最正确的！

1)启动Tomcat服务器，打开浏览器，输入http://localhost:8080/admin/（其中localhost是名称服务器或称为主机），
进入管理界面的登陆页面，这时候请输入原来安装时要求输入的用户名和密码，登陆到管理界面，

2)选择Resources－Data sources进入配置数据源界面，选择
 Data Source Actions －>选择Create New Data Source,进入配置详细信息界面
主要内容例如下：
JNDI Name:   ->jdbc/mysql
Data Source URL  ->jdbc:mysql://localhost:3306/db
JDBC Driver Class-> com.mysql.jdbc.Driver

3)修改/conf/context.xml,全部内容如下:
<Context>
<Resource name="jdbc/mysql"
 auth="Container"
       type="javax.sql.DataSource"
 driverClassName="com.mysql.jdbc.Driver"
        url="jdbc:mysql://172.16.0.25/db"
 username="root"
       password="root"
 maxActive="100"
 maxIdle="30"
 maxWait="10000" />
</Context>
4)修改web.xml

打开%TOMCAT_HOME%/conf/web.xml,在的前面添加以下内容：
    <resource-ref>
    <description>DB Connection</description>
    <res-ref-name>jdbc/mysql</res-ref-name>
    <res-type>javax.sql.DataSource</res-type>
    <res-auth>Container</res-auth>
    </resource-ref>
    注意res-ref-name填写的内容要与在上文提到的JNDI Name名称一致。
 到这里，配置工作就基本完成了!

5)引用JNDI时用"java:comp/env/jdbc/mysql";
有的时候直接应用JNDI名就可以，比如WEBLOGIC8。而TOMCAT就是这么做。

6)JDBC驱动程序mysql-connector-java-5.0.0-beta-bin.jar
一定要放置到%TOMCAT_HOME%/common/lib下。
重启你的Tomcat服务。