百度搜出来的一大堆方法都没有用，因为他们都是一样的，让你关掉校验：Window --》Preferences --》MyEclipse --》单击Validation。
但是还是没用，自动校验还是会出来，因为有一个选项是：Revalidate project when excluded resource list is modified.，也就是说一旦资源文件列表改变，MyEclipse还是会再自动校验一次，我这么多js文件（jQuery等等），这一校验何时是个头啊……
彻底关掉自动校验的方法是：在编辑器中右键，MyEclipse-》Manage Validation，里面有一个单选Enable project specific settings.，把它勾掉。并且，在Validation的子菜单Exluded Resources下面，把选项“Revalidate project when excluded resource list is modified.”勾掉。还有其他设置，自己根据需要修改。
补充一点：没必要关闭MyEclipse的全局校验功能，针对单独的项目设置一下即可（在项目名上右键，选择MyEclipse-》Manage Validation）