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在函数调用时参数被按照引用传递时是否发出警告。此方法已不被赞成并在 PHP/Zend 未来的版本中很可能不再支持。鼓励使用的方法是在函数定义中指定哪些参数应该用引用传递。鼓励大家尝试关闭此选项并确保脚本能够正常运行，以确保该脚本也能在未来的版本中运行（每次使用此特性都会收到一条警告）。

在函数调用时通过引用传递参数是不推荐的，因为它影响到了代码的整洁。如果函数的参数没有声明作为引用传递，函数可以通过未写入文档的方法修改其参数。要避免其副作用，最好仅在函数声明时指定那个参数需要通过引用传递。

参见引用的解释。

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PHP在升级到5.4版本的php可能会出现这种错误:

如果这样使用函数(或者类)的话，会产生一个 PHP Fatal error:
foo(&$var);
实际上，这样用法在php5.3中就会有提示，只是之前的仅仅会提示Deprecated而已。

// 正确写法
function myFunc(&$arg) { do something... }
 
myFunc($var);//Call myFunc
 
//错误写法
function myFunc($arg) { do something... }
 
myFunc(&$arg);//Call myFunc

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意思是调用时引用传参已经被移除了，就是不能通过function(&$a)这种方式传参调用函数.

解决方案：

查看你的php.ini配置文件，把其中的 allow_call_time_pass_reference参数调整为true，并重启服务器试试。 

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此外，以前的php代码在升级到5.4版本的php可能会出现这种错误:

当我们这样使用函数(或者类)的话，会产生一个error:

foo(&$var);

实际上，这样用本来就是错的，只是之前的错误级别仅仅是Deprecated而已。

而正确的使用方法应该是在函数定义时：

function foo(& $var) {
   //other code
}

而在调用时直接传参就行了： foo($var);

引用：

http://www.php.net/manual/zh/ini.core.php