Cygwin和android NDK下载安装完成后，配置android ndk开发环境，配置环境变量：
1、打开Cygwin的安装目录\home\<你的用户名>\ .bash_profile文件。
2、打开bash_profile文件，添加如下内容，然后保存：
NDK = /cygdrive/e/Android/Android_sdk_eclipse/android-ndk-r8
export NDK
打开Cygwin，输入cd $NDK，出现cygdrive /e/Android/Android_sdk_eclipse/android-ndk-r8表示设置成功。
在编辑.bash_profile文件时，保存后运行Cygwin，可能会出现类似“'/r'command not found”的问题，这是因为编辑器（记事本等）的原因造成的，输入如下命令可解决问题：dos2Unix.exe .bash_profile
编译NDK工程需要用到两个编译文件：Android.mk和Application.mk。下面逐一介绍：
1、Android.mk文件是GUN Makefile的一小部分，GUN Makefile通过这个文件编译C/C++代码，除了c和c++代码外，android.mk还可以编译其它类型的程序。
java程序：将java库文件编译成JAR文件
apk程序：将android程序编译成apk文件
c/c++动态库：将c/c++动态库编译成后缀名为“.so”的文件·
c/c++静态库：将c/c++静态库编译成后缀名为“.a”的文件·
2、编译c/c++代码时需要，用于描述当前程序需要的动态库和静态库，一般放置在<项目目录>/jni/Application.mk