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配置NHibernate有三种常见的配置方法。
1：在web.config,App.config里面配置

<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?>
<configuration>
<!-- Add this element -->
<configSections>
<section
name="hibernate-configuration"
type="NHibernate.Cfg.ConfigurationSectionHandler, NHibernate"
/>
</configSections>
<!-- Add this element -->
<hibernate-configuration xmlns="urn:nhibernate-configuration-2.2">
<session-factory>
   <property name="dialect">NHibernate.Dialect.MsSql2005Dialect</property>
   <property name="connection.provider">NHibernate.Connection.DriverConnectionProvider</property>
   <property name="connection.connection_string">Server=TLSZ207\SQLEXPRESS;initial catalog=Test;Integrated Security=true</property>
</session-factory>
</hibernate-configuration>
<!-- Leave the system.web section unchanged -->
<system.web>

</system.web>
</configuration>

则需要这样实例化Configuration对象。
NHibernate.Cfg.Configuration cfg = new NHibernate.Cfg.Configuration();
这种配置方法将会到应用程序配置文件（App.Config,Web.Config）中查找NHibernate的配置信息.

2：hibernate.cfg.xml
建立名为hibernate.cfg.xml的文件。实例化Configuration config = new Configuration().Configure();这样NHibernate将会在目录下寻找hibernate.cfg.xml的配置文件。
hibernate.cfg.xml的格式

<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?>
<hibernate-configuration  xmlns="urn:nhibernate-configuration-2.0" >
       <session-factory name="MySessionFactory">
   <property name="dialect">NHibernate.Dialect.MsSql2005Dialect</property>
   <property name="connection.provider">NHibernate.Connection.DriverConnectionProvider</property>
   <property name="connection.connection_string">Server=TLSZ207\SQLEXPRESS;initial catalog=Test;Integrated Security=true</property>
       </session-factory>
</hibernate-configuration>

3：指明配置文件
Configuration config = new Configuration().Configure(configFileName);
这种配置方法将查找指定的Hibernate标准配置文件，可以是绝对路径或者相对路径。还可以通过编码的方式来添加配置信息：
IDictionary props = new Hashtable();
props[“dialect”] = "NHibernate.Dialect.MsSql2005Dialect";
...
Configuration cfg = new Configuration();
cfg.Properties = props;//cfg.AddProperties(props);

映射文件：
所有的XML映射都需要使用nhibernate-mapping-2.0 schema。目前的schema可以在NHibernate的资源路径或者是NHibernate.dll的嵌入资源（Embedded Resource）中找到。NHibernate总是会优先使用嵌入在资源中的schema文件。你可以将hibernate-mapping拷贝到C:\Program Files\Microsoft Visual Studio .NET 2003\Common7\Packages\schemas\xml路径中，以获得智能感知功能。

<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?>
<hibernate-mapping xmlns="urn:nhibernate-mapping-2.2" namespace="Test" assembly="Test">
  <class name="Test.Cat,Test" table="Cat">
    <id name="CatID">
      <column name="CatID" sql-type="char(32)" not-null="true"/>
      <generator class="uuid.hex" />
    </id>
    <property name="Name">
      <column name="Name" length="16" not-null="true" />
    </property>
    <property name="Sex" />
    <property name="Weight" />
  </class>
</hibernate-mapping>

一般会用以下的三种方法
<1> config.AddXmlFile("User.hbm.xml");

<2> config.AddClass(typeof(Test.User));

<3> config.AddAssembly("Test");

NHibernate.Cfg.Configuration cfg = new NHibernate.Cfg.Configuration()
.AddXmlFile("User.hbm.xml")
.AddClass(typeof(Test.User)
.AddAssembly("Test");

为了方便，把映射类及XML放到同一个程序集里面。然后使用config.AddAssembly(assemblyName)的方式，让NHibernate自动去查找指定程序集中所有的映射文件和映射类。
在配置文件里面加入
<mapping assembly="Test" />，
如：

<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?>
<hibernate-configuration  xmlns="urn:nhibernate-configuration-2.0" >
       <session-factory name="MySessionFactory">
   <property name="dialect">NHibernate.Dialect.MsSql2005Dialect</property>
   <property name="connection.provider">NHibernate.Connection.DriverConnectionProvider</property>
   <property name="connection.connection_string">Server=TLSZ207\SQLEXPRESS;initial catalog=Test;Integrated Security=true</property>
   <mapping assembly="Test" />，
       </session-factory>
</hibernate-configuration>

那就省去了在代码里面捆绑程序集了。