两种方案：一种就是重新建一个web项目，然后拷贝原来项目的目录结构。第二种比较修改对应文件。
第一种：
1.首先eclipse确定是可以支持web开发的版本，然后要吧myeclipse项目的文件结构修改为eclipse的文件结构。
2.最简单的方法，在myeclipse中创建一个项目，把eclipse中的项目相关文件复制到myeclipse相关文件夹下就OK了。
第二种：
1、进入项目目录，找到.project文件，打开。
2、找到<natures>...</natures>代码段。
3、在第2步的代码段中加入如下标签内容并保存：
<nature>org.eclipse.jem.workbench.JavaEMFNature</nature>
<nature>org.eclipse.wst.common.modulecore.ModuleCoreNature</nature>
<nature>org.eclipse.wst.common.project.facet.core.nature</nature>
<nature>org.eclipse.jdt.core.javanature</nature>
<nature>org.eclipse.wst.jsdt.core.jsNature</nature>
4、删除.setting下的文件，从其它EclipseJee web项目[记住为了保险起见，一定要用eclipse新建一个]的.setting文件下拷贝以下文件[其实就是把整个文件夹都拷过来]
.jsdtscope
org.eclipse.jst.common.project.facet.core.prefs
org.eclipse.wst.common.component
org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml
org.eclipse.wst.jsdt.ui.superType.container
org.eclipse.wst.jsdt.ui.superType.name
修改org.eclipse.wst.common.component中项目名称相关的内容
比如下面的jngl_mysql换成你的项目名称。
然后wb-resource就是你的资源文件，默认是src一个。如果你是用maven可能是src/java/main，src/java/resource这些玩意。记得加上。
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<project-modules id="moduleCoreId" project-version="1.5.0">
<wb-module deploy-name="jngl_mysql">
<wb-resource deploy-path="/" source-path="/WebRoot" tag="defaultRootSource"/>
<wb-resource deploy-path="/WEB-INF/classes" source-path="/src"/>
<property name="context-root" value="jngl_mysql"/>
<property name="java-output-path" value="/jngl_mysql/WEB-INF/classes"/>
</wb-module>
</project-modules>
然后是.jsdtscope文件，这个里面记得改你的输出路径。
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<classpath>
<classpathentry kind="src" path="WebRoot"/>
<classpathentry kind="con" path="org.eclipse.wst.jsdt.launching.JRE_CONTAINER"/>
<classpathentry kind="con" path="org.eclipse.wst.jsdt.launching.WebProject">
<attributes>
<attribute name="hide" value="true"/>
</attributes>
</classpathentry>
<classpathentry kind="con" path="org.eclipse.wst.jsdt.launching.baseBrowserLibrary"/>
<classpathentry kind="output" path=""/>
</classpath>
5、在eclipse的项目上点右键，刷新项目。
6、在项目上点右键，进入属性（properties）
7、在左侧列表项目中点击选择“Project Facets”，在右侧看看不是选择了“Dynamic Web Module”和"Java"，如果有则成功了，如果没有就选上。