1.对于安装版的TOMCAT6.0：
进入TOMCAT的安装目录下的bin目录，双击tomcat6w.exe。点击Java选项卡，可设置初始化内存，最大内存，线程的内存大小。
(1)初始化内存：如果机器的内存足够大，可以直接将初始化内存设置为512M，如果机器内存较小可适当调小，对于运行了EJB的应用，最好不要低于128M。
(2)最大内存：最大内存目前设置为512M.
(3)线程内存大小：目前配置为1024KB，这也是JDK5.0后的默认配置。
对于容器下运行了多个WEB应用时，尽量将相同的JAR包转移到TOMCAT的lib下，此外还需要在JAVAOPTIONS加上如下配置：
-XX:PermSize=16m
-XX:MaxPermSize=128m
此配置表示JAVA永久保存区域（即不会被虚拟机回收）初始大小为16M，最大为128M。
2.对于解压版的TOMCAT6.0：
如果是WINDOWS操作系统，修改catalina.bat文件；否则修改catalina.sh文件。只需要在文件的头部加上”set JAVA_OPTS=-Xms512m -Xmx512m -Xss1024k”，数值分别对应了初始化的最小内存，最大内存，线程内存大小。如果JDK的版本是5.0之后的，线程内存可以不用设置。
对于容器下运行了多个WEB应用时，尽量将相同的JAR包转移到TOMCAT的lib下，此外还需要在JAVAOPTS后加上如下配置：
-XX:PermSize=16m -XX:MaxPermSize=128m
此配置表示JAVA永久保存区域（即不会被虚拟机回收）初始大小为16M，最大为128M。
参考：http://blog.sina.com.cn/s/blog_575267c60100k8n6.html