ibm的was连jdk都采用的自己的。下面把我的经验列一下：
1、include的文件要注意：
<%@ page contentType="text/html; charset=UTF-8"%>
这个在was5下不能被多次设置，include文件中如果有要去掉,不过was6.0以上就可以了。
2、web.xml中的serlvet标准
was5.1只支持2.3标准，was6.0以上才可以支持2.4，如果程序需要跨不同版本的应用服务器，最好采用2.3标准.
2.3的开头设置如下：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE web-app PUBLIC "-//Sun Microsystems, Inc.//DTD Web Application 2.3//EN" "http://java.sun.com/dtd/web-app_2_3.dtd">
<web-app>
2.4的如下:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<web-app xmlns="http://java.sun.com/xml/ns/j2ee"
xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" version="2.4"
xsi:schemaLocation="http://java.sun.com/xml/ns/j2ee http://java.sun.com/xml/ns/j2ee/web-app_2_4.xsd">
如果你有用spring，那么你肯定比较喜欢如下的配置：
<listener>
<listener-class>
org.springframework.web.context.ContextLoaderListener
</listener-class>
</listener>
<context-param>
<param-name>contextConfigLocation</param-name>
<param-value>
/WEB-INF/classes/applicationContext*.xml
</param-value>
</context-param>
但是很遗憾的说，在2.3的标准下是不能用的，这个实在让我很郁闷，还好spring还提供一个servlet供初始化
<servlet>
<servlet-name>SpringContextServlet</servlet-name>
<servlet-class>
org.springframework.web.context.ContextLoaderServlet
</servlet-class>
<load-on-startup>1</load-on-startup>
</servlet>
但是这样就不能设置contextConfigLocation参数了(或许有，是我还没找到),这样，如果配置文件有多个，比如：applicationContext-struts.xml,applicationContext-hibernate.xml等等，那么我就需要把他们合成一个文件，放到web-inf/applicationContext.xml，注意，不是web-inf/classes中。
3.ajax调用的编码问题：
如果你有用ajax去传一些中文，那么在从服务器端发往客户端时，你可能会用
response.setCharacterEncoding("GBK")，来解决乱码问题，但是再次很遗憾的说，这个方法是不被支持的，你可以用：response.setContentType("text/xml;charset=GBK");来替代，我也推荐这种方式。另外，request.setCharacterEncoding方法还是可以用的。
4.根据我的尝试，最好还是把servlet-api.jar包放进去，此包可以从tomcat里面找到
5.绝对要使用jdk1.4标准去编译，不是要你使用1.4的jdk,只是把构建的标准改为1.4就可以了。如果编译不过去，那你就去老老实实改程序吧，不要去浪费时间想什么外门邪道，比如去更改was的jdk等等疯狂举动。所以，jdk5.0及以后版本中新增的一些新玩意，如果你不能确定客户使用的服务器软件支持的话，最好还是不要使用。
6.不要写文件到服务器，否则在群集部署的时候就会有问题了。
来源于：http://blog.sina.com.cn/s/blog_7833c8450100una5.html