配对设计主要研究某种实验处理前后的对比状况，来判定该种处理是否有效。该种方法能够有效地控制非实验因素对结果的影响。
需要注意的是实验前后的结果不是独立的，就是说实验前的状况对实验后的结果是有影响的。统计学上通常会通过差值来消除这种影响，也可以考虑进行两独立样本的检验。这里分别用两种软件实现第一种方法。
例子：考察16个病人服药前后的weights和triglyceride levels,具体数据见附件。
1.SPSS
Analyze-Compare Means-Paired Samples T test,然后选择配对变量
2.SAS（UNIVARIATE语句详解参考：http://543484067.qzone.qq.com/blog/1294717032）
将数据导入SAS后进行如下操作
data y;
set a;
tg=tg0-tg4;
wgt=wgt0-wgt4;
run;
proc univariate data=y normal;
var tg wgt;
run;
下面我们看看两种结果的比较：
| Paired Samples Statistics | |||||
| Mean | N | Std. Deviation | Std. Error Mean | ||
| Pair 1 | Triglyceride | 138.44 | 16 | 29.04 | 7.26 |
| Final triglyceride | 124.38 | 16 | 29.412 | 7.353 | |
| Pair 2 | Weight | 198.38 | 16 | 33.472 | 8.368 |
| Final weight | 190.31 | 16 | 33.508 | 8.377 | |
|
Paired Samples Test |
||||
|
|
|
Paired Differences |
||
|
|
|
|
||
|
|
|
Mean |
Std. Deviation |
Std. Error Mean |
|
Pair 1 |
Triglyceride - Final triglyceride |
14.063 |
46.875 |
11.719 |
|
Pair 2 |
Weight - Final weight |
8.063 |
2.886 |
.722 |
|
Paired Samples Test |
|||
|
|
|
Paired Differences |
|
|
|
|
95% Confidence Interval of the Difference |
|
|
|
|
Lower |
Upper |
|
Pair 1 |
Triglyceride - Final triglyceride |
-10.915 |
39.040 |
|
Pair 2 |
Weight - Final weight |
6.525 |
9.600 |
|
Paired Samples Test |
||||
|
|
|
|
||
|
|
|
|
||
|
|
|
t |
df |
Sig. (2-tailed) |
|
Pair 1 |
Triglyceride - Final triglyceride |
1.200 |
15 |
.249 |
|
Pair 2 |
Weight - Final weight |
11.175 |
15 |
.000 |
SAS结果（部分）：
变量: tg
矩
N 16 权重总和 16
均值 14.0625 观测总和 225
标准差 46.8749667 方差 2197.2625
偏度 -0.0645782 峰度 -1.1826074
未校平方和 36123 校正平方和 32958.9375
变异系数 333.333096 标准误差均值 11.7187417
基本统计测度
位置 变异性
均值 14.06250 标准差 46.87497
中位数 18.00000 方差 2197
众数 . 极差 152.00000
四分位极差 79.50000
位置检验: Mu0=0
检验 --统计量--- -------P 值-------
学生 t t 1.200001 Pr > |t| 0.2487
符号 M 1 Pr >= |M| 0.8036
符号秩 S 23 Pr >= |S| 0.2522
变量: wgt
矩
N 16 权重总和 16
均值 8.0625 观测总和 129
标准差 2.88602957 方差 8.32916667
偏度 0.72763584 峰度 -0.479326
未校平方和 1165 校正平方和 124.9375
变异系数 35.7957156 标准误差均值 0.72150739
基本统计测度
位置 变异性
均值 8.062500 标准差 2.88603
中位数 7.000000 方差 8.32917
众数 6.000000 极差 10.00000
四分位极差 4.50000
位置检验: Mu0=0
检验 --统计量--- -------P 值-------
学生 t t 11.17452 Pr > |t| <.0001
符号 M 8 Pr >= |M| <.0001
符号秩 S 68 Pr >= |S| <.0001
附：
| patid | age | gender | tg0 | tg1 | tg2 | tg3 | tg4 | wgt0 | wgt1 |
| 1 | 45 | 0 | 180 | 148 | 106 | 113 | 100 | 198 | 196 |
| 2 | 56 | 0 | 139 | 94 | 119 | 75 | 92 | 237 | 233 |
| 3 | 50 | 0 | 152 | 185 | 86 | 149 | 118 | 233 | 231 |
| 4 | 46 | 1 | 112 | 145 | 136 | 149 | 82 | 179 | 181 |
| 5 | 64 | 0 | 156 | 104 | 157 | 79 | 97 | 219 | 217 |
| 6 | 49 | 1 | 167 | 138 | 88 | 107 | 171 | 169 | 166 |
| 7 | 63 | 0 | 138 | 132 | 146 | 143 | 132 | 222 | 219 |
| 8 | 63 | 1 | 160 | 128 | 150 | 118 | 123 | 167 | 167 |
| 9 | 52 | 0 | 107 | 120 | 129 | 195 | 174 | 199 | 200 |
| 10 | 45 | 0 | 156 | 103 | 126 | 135 | 92 | 233 | 229 |
| 11 | 61 | 1 | 94 | 144 | 114 | 114 | 121 | 179 | 181 |
| 12 | 49 | 1 | 107 | 93 | 156 | 148 | 150 | 158 | 153 |
| 13 | 61 | 1 | 145 | 107 | 129 | 86 | 159 | 157 | 151 |
| 14 | 59 | 0 | 186 | 142 | 128 | 122 | 101 | 216 | 213 |
| 15 | 52 | 0 | 112 | 107 | 103 | 89 | 148 | 257 | 255 |
| 16 | 60 | 1 | 104 | 103 | 117 | 79 | 130 | 151 | 146 |