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FlashFTP工具 有自动缓存服务器目录的功能，如果选中的话会加快FTP目录读取的速度，但同时也会造成服务器端的目录结构改了，但是客户端的仍然显示的是修改前的目录。

所以建议还是不勾选。地址： ftp站点管理器-》选项， 将缓存服目录去掉。