学步园

链接：

http://poj.org/problem?id=3080

题目大意：

给出m（2<=m<=10）个DNA序列， 求出这m个序列中最长的公共字串。如果有多个相同长度的，输出字典序最小的。

分析与总结:

依次枚举所有的子串， 然后再看是否在所有序列中都能够匹配。保存下长度最大且字典序最小的序列。

代码：

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstring>
using namespace std;

const int MAXN = 1000005;
const int N = 60;
int nMax;
char seq[12][85];
char ans[85];
int  f[85];

void getFail(char *p, int *f){
    int m=strlen(p);
    f[0]=f[1]=0;
    for(int i=1; i<m; ++i){
        int j=f[i];
        while(j && p[i]!=p[j])j=f[j];
        f[i+1] = p[i]==p[j]?1+j:0;
    }
}
bool find(char *T,char *p,int *f){
    getFail(p,f);
    int n=strlen(T);
    int m=strlen(p);
    int j=0;
    for(int i=0; i<n; ++i){
         while(j && T[i]!=p[j])j=f[j];
         if(T[i]==p[j])++j;
         if(j==m){
             return true;
         }
    }
    return false;
}

int main(){
    int nCase, m;
    char str[85];
    scanf("%d",&nCase);
    while(nCase--){
        scanf("%d",&m);
        for(int i=0; i<m; ++i){
            scanf("%s",seq[i]);
        }

        bool ok=false;
        nMax=3;
        // 枚举所有子串
        for(int i=0; i<m; ++i){

            for(int j=0; j<N-3; ++j){ //枚举起点
                memset(str, 0, sizeof(str));
                for(int k=j,p=0; k<N; ++k){
                    str[p++]=seq[i][k];

                    if(p>=nMax){
                        bool flag=false;
                        for(int l=0; l<m; ++l)if(l!=i){
                            if(!find(seq[l],str,f)){
                                flag=true;
                                break;
                            }
                        }
                        if(!flag){
                            if(p==nMax){
                                if(!ok){
                                    ok=true;
                                    strcpy(ans,str);
                                }
                                else if(strcmp(ans,str)>0){
                                    strcpy(ans,str);
                                }
                            }
                            else if(p>nMax){
                                nMax=p;
                                strcpy(ans,str);
                            }
                        }
                        else{
                            break;  // 如果这个长度不能匹配了，那么更长的也全部都不能匹配
                        }
                    }
                }
            }
        }
        if(ok)puts(ans);
        else puts("no significant commonalities");
    }
    return 0;
}

 ——  生命的意义，在于赋予它意义士。

          原创 http://blog.csdn.net/shuangde800 ， By
  D_Double  (转载请标明)