刚重装了ubuntu系统，重新配置了jdk1.7环境。在/etc/profile中添加了java环境变量，通过source执行profile脚本后，使用java和java -version命令可看到jdk的相关信息。
本以为配置已经成功了，但每次重启系统之后都会提示没有安装jdk这么奇怪的现象。而且系统还提示:
检测到系统程序出现问题。
后来重新source了一遍profile文件，貌似又没有问题了。但是在eclipse工程中启动tomcat时，又莫名其妙的崩溃：
org.eclipse.jst.j2ee.internal.deployables.JEEFlattenParticipantProvider
#
# A fatal error has been detected by the Java Runtime Environment:
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# SIGSEGV (0xb) at pc=0x00007fb5391895a0, pid=3010, tid=140418841745152
#
# JRE version: 7.0_11-b21
# Java VM: Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (23.6-b04 mixed mode linux-amd64 compressed oops)
# Problematic frame:
# C [libwebkitgtk-1.0.so.0+0x14245a0] void WTF::freeOwnedGPtr<_GdkEvent>(_GdkEvent*)+0x15df0
#
# Failed to write core dump. Core dumps have been disabled. To enable core dumping, try "ulimit -c unlimited" before starting Java again
#
# An error report file with more information is saved as:
# /opt/eclipse/hs_err_pid3010.log
#
# If you would like to submit a bug report, please visit:
# http://bugreport.sun.com/bugreport/crash.jsp
# The crash happened outside the Java Virtual Machine in native code.
# See problematic frame for where to report the bug.
#
不得不怀疑jdk的配置出了问题。在终端中，一个个的echo环境变量：
echo $JAVA_HOME
echo $JRE_HOME
echo $CLASSPATH
echo $PATH
echo $TOMCAT_HOME
结果发现jre路径不正常，JRE_HOME出了问题。很羞愧的改正了过来，但不是很明白，之前为什么在环境变量还有问题的情况下，还可以查看java信息。
重启，并且在eclipse中重新配置了tomcat服务后，运行正常。