分子图形系列软件
MOL4DE(E代表一般性增强)保留MOL4D基本型的所有功能,再增加了下列几种模型:网球状模型、表面电势模型、分子极性模型。后2种模型在研究药物分子的性能时有用。
为了显示后2种模型,要求分子数据中每个电子正确记录电子密度数据。
MOL4DE的上述几种模型全部利用深度缓冲法(Z-Buffer法)制作。Z-Buffer法优点是可以把几种模型叠加显示,这一功能在显示蛋白质高级功能非常有用。
利用MOL4DE也能方便制作任意分子的CPK模型,因为它不需要预先对原子作深度排序,就能正确消去隐藏面,且图形也很清晰,如图4所示。
MOL4DE介绍
MOL4DE(E代表一般性增强)保留MOL4D基本型的所有功能,再增加了下列几种模型:网球状模型、表面电势模型、分子极性模型。后2种模型在研究药物分子的性能时有用。
为了显示后2种模型,要求分子数据中每个电子正确记录电子密度数据。
MOL4DE的上述几种模型全部利用深度缓冲法(Z-Buffer法)制作。Z-Buffer法优点是可以把几种模型叠加显示,这一功能在显示蛋白质高级功能非常有用。
利用MOL4DE也能方便制作任意分子的CPK模型,因为它不需要预先对原子作深度排序,就能正确消去隐藏面,且图形也很清晰,如图4所示。
图1 利用MOL4DE为药物分子AT2153制作的网球状模型
图2
利用MOL4DE为璜胺类药物SULFAGU制作的表面电势模型
图3利用MOL4DE为璜胺类药物SULFA制作的极性模型(蓝正红负)
图4
利用MOL4DE为药物分子AT2153制作的CPK模型,
原子用什么颜色可选,这里使用默认色:碳-黄,氧-红,氮-天蓝,氢-白